Озера можно различать по солёности воды на пресноводные, солоноватые и солёные.

Пресноводные озера имеют низкую солёность и содержат пресную воду. Они обычно образуются за счет дождевых осадков, речных вод или подземных источников.

Солоноватые озера имеют умеренную солёность, обычно они находятся в прибрежных зонах и могут быть связаны со смешиванием пресной и морской воды.

Солёные озера имеют высокую солёность и содержат большое количество минералов и солей. Они обычно образуются в засушливых районах, где происходит быстрое испарение воды, оставляя за собой высокую концентрацию солей.

По происхождению котловины озера могут быть кратерными (образуются в кратерах вулканов), ледниковыми (образуются в результате обмеления и расплавления ледников), тектоническими (образуются в результате геологической деятельности) и дренировочными (образуются в результате действия дрейна).