Обсудите, как энтропия и свободная энергия Гиббса определяют спонтанность биохимических процессов в клетке, приведите пример, где процесс совмещается с гидролизом АТФ
Коротко — термодинамика определяет, пойдёт ли реакция сама по себе: при постоянных давлении и температуре критическая величина — изменение энергии Гиббса. - Критерий спонтанности: ΔG=ΔH−TΔS\Delta G=\Delta H-T\Delta SΔG=ΔH−TΔS. Если ΔG<0\Delta G<0ΔG<0, процесс спонтанен; если ΔG=0\Delta G=0ΔG=0, равновесие; если ΔG>0\Delta G>0ΔG>0, процесс неспонтанен в данных условиях. - Связь с энтропией среды и системы: при постоянных T,pT,pT,p изменение суммарной энтропии вселенной связано с ΔG\Delta GΔG как ΔSuniv=ΔSsys+ΔSsurr=ΔSsys−ΔHsysT=−ΔGT\Delta S_{univ}=\Delta S_{sys}+\Delta S_{surr}=\Delta S_{sys}-\dfrac{\Delta H_{sys}}{T}=-\dfrac{\Delta G}{T}ΔSuniv=ΔSsys+ΔSsurr=ΔSsys−TΔHsys=−TΔG. То есть ΔG<0\Delta G<0ΔG<0 эквивалентно ΔSuniv>0\Delta S_{univ}>0ΔSuniv>0. - Биохимические условия: стандартная свободная энергия \(\Delta G^\circ '\) задаёт «стандартный» знак реакции, но реальное изменение зависит от концентраций: \(\Delta G=\Delta G^\circ '+RT\ln Q\), где QQQ — реакционный коэффициент, RRR — универсальная газовая постоянная, TTT — абсолютная температура. В клетке за счёт неравновесных концентраций ΔG\Delta GΔG может существенно отличаться от \(\Delta G^\circ '\). Механизм «связывания» неблагоприятной реакции с выгодной — через ферментативное сопряжение: фермент обеспечивает совместное выполнение двух шагов (или образует общий промежуточный метаболит), так что суммарное ΔG\Delta GΔG двух реакций складывается. Пример (фосфорилирование глюкозы при входе в гликолиз): - неблагоприятный шаг (глюкоза + Pi→ \mathrm{Pi} \rightarrow Pi→ глюкоза‑6‑фосфат) имеет прибл. \(\Delta G^\circ '\approx+13.8\ \mathrm{kJ/mol}\); - гидролиз АТФ (ATP+H2O→ADP+Pi\mathrm{ATP}+\mathrm{H_2O}\rightarrow\mathrm{ADP}+\mathrm{Pi}ATP+H2O→ADP+Pi) при стандартных условиях: \(\Delta G^\circ '\approx-30.5\ \mathrm{kJ/mol}\) (в клетке обычно ещё более отрицательно, ~−50 kJ/mol-50\ \mathrm{kJ/mol}−50kJ/mol из‑за концентраций). Сопровождённая реакция (катализируемая гексокиназой): glucose+ATP→glucose − 6 − P+ADP\mathrm{glucose}+\mathrm{ATP}\rightarrow\mathrm{glucose\!-\!6\!-\!P}+\mathrm{ADP}glucose+ATP→glucose−6−P+ADP, суммарное стандартное изменение энергии: \(\Delta G^\circ '_{\text{общ}} \approx +13.8 + (-30.5) = -16.7\ \mathrm{kJ/mol}\). То есть связывание неблагоприятного шага с гидролизом АТФ делает суммарную реакцию спонтанной (ΔG<0\Delta G<0ΔG<0); фермент обеспечивает координацию шагов и перенос фосфата. Коротко: энтропия и энтальпия через ΔG\Delta GΔG определяют спонтанность; в клетке неблагоприятные процессы делаются спонтанными за счёт сопряжения с сильно экзергоническим гидролизом АТФ, что уменьшает суммарное ΔG\Delta GΔG до отрицательного значения.
- Критерий спонтанности:
ΔG=ΔH−TΔS\Delta G=\Delta H-T\Delta SΔG=ΔH−TΔS.
Если ΔG<0\Delta G<0ΔG<0, процесс спонтанен; если ΔG=0\Delta G=0ΔG=0, равновесие; если ΔG>0\Delta G>0ΔG>0, процесс неспонтанен в данных условиях.
- Связь с энтропией среды и системы:
при постоянных T,pT,pT,p изменение суммарной энтропии вселенной связано с ΔG\Delta GΔG как
ΔSuniv=ΔSsys+ΔSsurr=ΔSsys−ΔHsysT=−ΔGT\Delta S_{univ}=\Delta S_{sys}+\Delta S_{surr}=\Delta S_{sys}-\dfrac{\Delta H_{sys}}{T}=-\dfrac{\Delta G}{T}ΔSuniv =ΔSsys +ΔSsurr =ΔSsys −TΔHsys =−TΔG .
То есть ΔG<0\Delta G<0ΔG<0 эквивалентно ΔSuniv>0\Delta S_{univ}>0ΔSuniv >0.
- Биохимические условия: стандартная свободная энергия \(\Delta G^\circ '\) задаёт «стандартный» знак реакции, но реальное изменение зависит от концентраций:
\(\Delta G=\Delta G^\circ '+RT\ln Q\), где QQQ — реакционный коэффициент, RRR — универсальная газовая постоянная, TTT — абсолютная температура. В клетке за счёт неравновесных концентраций ΔG\Delta GΔG может существенно отличаться от \(\Delta G^\circ '\).
Механизм «связывания» неблагоприятной реакции с выгодной — через ферментативное сопряжение: фермент обеспечивает совместное выполнение двух шагов (или образует общий промежуточный метаболит), так что суммарное ΔG\Delta GΔG двух реакций складывается.
Пример (фосфорилирование глюкозы при входе в гликолиз):
- неблагоприятный шаг (глюкоза + Pi→ \mathrm{Pi} \rightarrow Pi→ глюкоза‑6‑фосфат) имеет прибл. \(\Delta G^\circ '\approx+13.8\ \mathrm{kJ/mol}\);
- гидролиз АТФ (ATP+H2O→ADP+Pi\mathrm{ATP}+\mathrm{H_2O}\rightarrow\mathrm{ADP}+\mathrm{Pi}ATP+H2 O→ADP+Pi) при стандартных условиях: \(\Delta G^\circ '\approx-30.5\ \mathrm{kJ/mol}\) (в клетке обычно ещё более отрицательно, ~−50 kJ/mol-50\ \mathrm{kJ/mol}−50 kJ/mol из‑за концентраций).
Сопровождённая реакция (катализируемая гексокиназой):
glucose+ATP→glucose − 6 − P+ADP\mathrm{glucose}+\mathrm{ATP}\rightarrow\mathrm{glucose\!-\!6\!-\!P}+\mathrm{ADP}glucose+ATP→glucose−6−P+ADP,
суммарное стандартное изменение энергии:
\(\Delta G^\circ '_{\text{общ}} \approx +13.8 + (-30.5) = -16.7\ \mathrm{kJ/mol}\).
То есть связывание неблагоприятного шага с гидролизом АТФ делает суммарную реакцию спонтанной (ΔG<0\Delta G<0ΔG<0); фермент обеспечивает координацию шагов и перенос фосфата.
Коротко: энтропия и энтальпия через ΔG\Delta GΔG определяют спонтанность; в клетке неблагоприятные процессы делаются спонтанными за счёт сопряжения с сильно экзергоническим гидролизом АТФ, что уменьшает суммарное ΔG\Delta GΔG до отрицательного значения.