Быстрая бомбардировка атомами может использоваться в различных областях, таких как научные исследования, технологические процессы и медицинская диагностика и лечение. Например, быстрая бомбардировка атомами может быть использована для создания новых материалов с уникальными свойствами, исследования структуры и свойств поверхностей материалов, диагностики и лечения раковых опухолей, а также в производстве полупроводников и тонкопленочных покрытий.