Гибридизация определяется не только наличием или отсутствием неподеленных пар электронов, но и электронной структурой атомов в молекуле.

В случае NF3, атом азота имеет одну неподеленную пару электронов и три связи с атомами фтора. При гибридизации sp3 одна s-орбиталь азота и три p-орбитали объединяются для образования четырех одинаковых гибридизированных орбиталей, в которых находятся электроны, образующие связи. В результате образуется трехмерная структура, напоминающая пирамиду.

В случае AsO4(3-), атом мышьяка имеет окружение из четырех кислородных атомов, каждый из которых образует одну двойную связь и две одинарные соединения с атомом мышьяка. Гибридизация sp3d1 включает одну s-орбиталь и три p-орбитали мышьяка, а также одну d-орбиталь, которая участвует в образовании пяти гибридизированных орбиталей. Это приводит к формированию тригональной бипирамиды или тетрагональной пирамиды, в зависимости от распределения кислородных атомов вокруг атома мышьяка.

Таким образом, форма молекулы определяется не только типом гибридизации, но и конфигурацией электронов в молекуле.