Атоми гідрогену і хлору мають різну будову. Атом гідрогену містить лише один протон у ядрі і один електрон, знаходиться на першому енергетичному рівні. Атом хлору містить у ядрі 17 протонів та 18 нейтронів (якщо розглядати стабільний ізотоп хлору-35), має 17 електронів та розташовується на третьому енергетичному рівні. Це робить їх хімічні властивості суттєво відмінними: гідроген може утворювати ковалентні зв'язки з іншими елементами, в той час як хлор більш активний та може утворювати іонні зв'язки з іншими елементами.