Цис-транс изомерия возможна у таких углеводородов, как ненасыщенные углеводороды, содержащие двойные связи. Например, алкены, арены и другие углеводороды, в которых присутствуют двойные связи, могут образовывать цис- и транс-изомеры в зависимости от пространственного расположения заместителей относительно двойной связи.