Пример решения на Python:

import random
# Создаем двумерный массив и заполняем его натуральными числами от 100 до 9999
n = 5
array = [[random.randint(100, 9999) for j in range(n)] for i in range(n)]
# Выводим исходный массив
print("Исходный массив:")
for row in array:
print(row)
# Создаем новый массив, заменяя каждый элемент на цифру сотен
new_array = [[int(str(num)[1]) for num in row] for row in array]
# Выводим новый массив
print("\nНовый массив:")
for row in new_array:
print(row)

Этот код создает двумерный массив размером n x n, заполняет его натуральными числами от 100 до 9999, затем находит цифру сотен для каждого числа и создает новый массив, заменяя каждый элемент на цифру сотен.