В 16-17 веках отношения между учёными и церковью были довольно сложными. С одной стороны, церковь представляла собой влиятельную организацию, контролирующую многие аспекты жизни общества, включая образование и науку. С другой стороны, учёные стремились к независимости и свободе в исследованиях, часто противоречащих установленным церковным доктринам.

Церковь пристально следила за развитием астрономии, физики и медицины, потому что эти области науки привлекали внимание общественности и могли иметь важные последствия для церковной доктрины. Например, открытия Коперника о гелиоцентрической системе искусственно освещенной планетой Луне противоречили геоцентрической модели Вселенной, пропагандируемой церковью. Поэтому церковь не хотела, чтобы новые научные открытия подрывали её авторитет.

В результате многие учёные сталкивались с преследованиями и цензурой со стороны церкви за свои работы. Некоторые были обвинены в ереси и осуждены церковными трибуналами. Однако несмотря на это, развитие науки продолжалось, и с течением времени церковь стала более толерантной к научным исследованиям.

Таким образом, хотя на первый взгляд астрономия, физика и медицина могли казаться далекими от теологии, они имели потенциал изменить устоявшиеся представления о мире и месте человека в нём, что вызывало беспокойство и интерес со стороны церкви.