На территории Кыргызстана существовали несколько тюркских каганатов в разные исторические периоды. Один из самых известных - Каганат Уйгуров, который существовал в VIII-IX веках и охватывал территорию современного южного и восточного Кыргызстана. Его столицей был город Баласагун, расположенный на месте современного города Токмак.

Еще одним важным тюркским каганатом на территории Кыргызстана был Каганат Карлуков, который существовал в IX-X веках. Он охватывал территорию северного и северо-восточного Кыргызстана и имел своей столицей город Баласагун.

Также на территории современного Кыргызстана существовали каганаты других тюркских племен, такие как каганат Кыпчаков, которые в разное время оказывали влияние на эти земли.