"Стоначальник" - это устаревшее русское слово, которое означает начальника, руководителя или начальствующего лица. Такое выражение использовалось ранее для обозначения высшего руководящего лица на предприятии, организации или в учреждении. В современном русском языке это слово практически не используется.