Институт молекулярной медицины МГУ был создан на базе факультета фундаментальной медицины, который был создан в 2009 году при поддержке президента Российской Федерации Владимира Путина. Главной целью создания университетского института было объединение образовательных и научных возможностей для развития молекулярной медицины и биотехнологий в России. В рамках имммат активно ведется работа по исследованию и разработке новых методов диагностики, профилактики и лечения различных заболеваний на молекулярном уровне.