Джунгарское ханство было уничтожено в результате военной кампании, проведенной китайским императором Цунцзы в середине XVIII века. Основным событием в этой кампании было уничтожение столицы Джунгарии — города Гульджа в 1759 году.

После захвата Гульджи, китайская армия продолжила наступление и полностью разгромила джунгарскую конфедерацию. Император Цунцзы приказал уничтожить всех мужчин, женщин и детей старше трех лет, что привело к практически полному истреблению джунгарского народа.

Таким образом, Джунгарское ханство было окончательно уничтожено китайскими войсками в середине XVIII века.