Для шифрования трафика между клиентом и сервером можно использовать протокол HTTPS, который обеспечивает безопасное соединение с использованием шифрования. Для этого необходимо установить SSL сертификат на сервере и настроить его правильно. Клиент и сервер будут обмениваться данными, зашифрованными с использованием этого сертификата.

Если у вас уже реализован алгоритм шифрования на C#, его можно использовать для шифрования данных перед отправкой на сервер и дешифрования данных при их получении. Для этого вам понадобится использовать этот алгоритм в коде вашего клиентского приложения.

Существует также множество библиотек и фреймворков, которые помогут вам с шифрованием трафика, например, OpenSSL, Bouncy Castle, Crypto++. Вы можете найти множество примеров кода и документации о том, как использовать эти библиотеки для шифрования данных.

Рекомендуется изучить основные принципы шифрования данных и работы с SSL протоколом, чтобы правильно настроить безопасное соединение между клиентом и сервером. Вам также стоит изучить принципы обмена ключами, чтобы обеспечить безопасность передачи данных.