Да, можно установить Windows Server 2016 в качестве контроллера домена в домене 2008R2. Однако, перед установкой Windows Server 2016 вам следует убедиться, что ваша текущая инфраструктура поддерживает новую версию сервера и выполнить необходимые шаги для подготовки к обновлению.

Основная ограничение при установке Windows Server 2016 в среде домена 2008R2 может быть связано с функциональным уровнем домена. Уровень функциональности домена определяет доступные функции и возможности, которые могут быть использованы в среде домена. Поэтому, перед установкой Windows Server 2016, убедитесь, что у Вас установлен соответствующий уровень функциональности домена для поддержки новой версии Windows Server.

Также, необходимо помнить о необходимости выполнения тщательного планирования и резервного копирования данных перед обновлением системы, чтобы избежать потери данных и проблем в процессе обновления.

Надеюсь, что это поможет вам успешно установить Windows Server 2016 в качестве контроллера домена в среде домена 2008R2.