Для запуска серверных утилит через веб-интерфейс на Node.js можно воспользоваться модулем child_process, который позволяет выполнить внешние команды в операционной системе.

Пример запуска утилиты ls (вывод содержимого директории) средствами Node.js:

const { exec } = require('child_process');
exec('ls', (error, stdout, stderr) => {
if (error) {
console.error(`exec error: ${error}`);
return;
}
console.log(`stdout: ${stdout}`);
console.error(`stderr: ${stderr}`);
});

Для хранения истории запущенных утилит на сервере можно использовать базу данных. Вы можете создать таблицу с полями для хранения информации о запущенных утилитах, например, название утилиты, аргументы, результат выполнения и т.д.

При каждом запуске утилиты веб-приложение должно сохранять информацию о запущенной утилите в базу данных.

Это лишь пример подхода к решению вашей задачи. Не забудьте обеспечить безопасность вашего приложения и проверять ввод пользователя перед его выполнением через child_process.