Наиболее рациональным способом распределения памяти будет второй вариант: диск C Windows и /root Ubuntu на одном, диск D и /home объединены на другом, внешний для тяжеловесных файлов и бекапов.

Этот вариант позволяет разделить операционные системы на отдельные диски, что улучшит производительность каждой из них. Также объединение /home позволит эффективнее использовать пространство на диске.

Бекапы можно хранить как на внешнем диске, так и на внутреннем, что обеспечит дополнительную защиту от потери данных.

Этот вариант сохраняет баланс между производительностью, удобством использования и надежностью хранения данных.