Для генерации подписи на VPS и защиты ключей, можно следовать следующим рекомендациям:

Перед генерацией ключей, убедитесь, что ваш VPS обеспечивает безопасное окружение, например, обновленную операционную систему, firewall, антивирусное программное обеспечение и другие меры безопасности.

Генерация ключей должна выполняться с помощью надежного генератора ключей, такого как OpenSSL, GPG и т. д., при этом ключи должны быть достаточно длинными и сложными для обеспечения безопасности.

Для защиты ключей следует хранить их в безопасном месте, например, в отдельной зашифрованной директории на сервере, с ограниченным доступом только для аутентифицированных пользователей.

Для защиты программы и ключей от несанкционированного доступа или модификации, рекомендуется использовать механизмы шифрования и цифровой подписи, чтобы обеспечить целостность и подлинность программного кода и ключей.

Также стоит регулярно обновлять программное обеспечение, следить за уязвимостями и применять патчи безопасности для обеспечения надежности и защиты сервера.

Для более точных и индивидуальных советов и рекомендаций, возможно, стоит обратиться к специалисту по информационной безопасности или к управляющему вашим VPS-сервером.