Да, в данном случае "скорее" следует обособить, поскольку это вводное слово, выделяющее противопоставление и вносящее нюанс в вопрос. Правильное написание: "Поступил ли он правильно? Или все-таки его поступок — это, скорее, ошибка неверного выбора?"