Не совсем понятен ваш вопрос. Если у вас есть противоречия и вам нужно их разрешить, то да, иногда нужно поставить запятую, чтобы разделить различные аспекты или мысли. Но также есть и другие способы избежать или разрешить противоречия, например, обсуждение, аргументация, компромисс и т. д.