Омонимы можно подчеркнуть с помощью курсива, например: бар и бар.

Можно выделить омонимы жирным шрифтом: бар и бар.

Также можно использовать кавычки для выделения омонимов: "бар" и "бар".

Для тех, кто пишет от руки, можно просто подчеркнуть омонимы линией под словами: бар и бар.