Да, слова "ваять", "свая" и "обаяние" относятся к этимологически однокоренным словам. Префикс "об-" в слове "обаяние" имеет значение "окружающий", "объемлющий", что соответствует основе слова "аян" - что-то обнимающее, окружающее. Таким образом, все эти слова имеют общее происхождение и связаны с идеей формирования, создания или окружения чего-либо.