куклы:

кукл (сущ., ед. число, родительный падеж) - основа слова, кореньы (суффикс, множественное число, именительный падеж) - окончание, указывающее на множественное число, падеж слова

Итоговый разбор:
кукл (сущ., ед. число, родительный падеж) + ы (суффикс, множественное число, именительный падеж)

Слово "куклы" является множественным числом от слова "кукла", обозначает несколько кукол.