Зависит от контекста и задачи. Если вы хотите уточнить основу слова, то подберите корень. Если нужно обозначить начальный элемент слова, который несет основной смысл, то выберите корень или основу. Если необходимо указать часть слова, добавленную к корню для образования нового слова, то подберите суффикс, приставку или окончание.