Правильное написание будет "замену (не)допущенной", поскольку в данном случае используются скобки для выделения фразы "не допущенной" как пояснения к слову "замену". Слова "замену" и "(не)допущенной" являются грамматически самостоятельными и поэтому пишутся раздельно.