рассеянный - от рассеять в значении сеять - глагол - рассеяны - краткое причастие

человек рассеянный - в значении невнимательный, человек рассеян - невнимателен

она рассеянна - в значении невнимательна, согласно правилу перехода причастий в отглагольные прилагательные или образование отглагольных прилагательных от глагола с переносным значением,

В вашем случае в предложении нужна -Н-, так как вряд мысли могут быть невнимательными, невнимателен человек, и хотя здесь "мысли" соотносятся с "тучами", однако слово использовано в прямом значении рассеять мысли и рассеять тучи, а не быть рассеянным, невнимательным. В случае, если причастие легко превратить в глагол - перед нами однозначно краткое причастие, а не отглагольное прилагательное:

Поэтому ваш вариант был верным:

Мысли в ней рассеяны (= глаголу мысли в ней рассеяли), как тучи после бури.