Морфемный разбор слова "несколькими":

нес- (префикс, обозначающий отрицание) + -кольк- (основа) + -ими (суффикс, образующий форму множественного числа прилагательного среднего рода в родительном падеже).

Таким образом, слово "несколькими" состоит из трех морфем: префикса "нес-", основы "-кольк-" и суффикса "-ими".