Основные правила постановки знаков препинания в составные предложения (ССП) и сложноподчиненные предложения (СПП) следующие:

В составных предложениях и сложноподчиненных предложениях между простыми предложениями и связанными союзами ставится запятая (,).
Пример:
Составное предложение: Я пошел в магазин, а моя сестра осталась дома.
Сложноподчиненное предложение: Я вернусь, когда закончу работу.

Если сложный предложение начинается с придаточного предложения, то перед главным (основным) предложением обычно ставится запятая.
Пример:
Когда осветило, скворцы защебетали.

При наличии обособленных вставочных конструкций (приложений, пояснений) ставятся запятые до и после них.
Пример:
Согласно договору, который мы заключили, все было предельно ясно.

В случае уточнительных, пояснительных придаточных предложений обычно ставятся запятые.
Пример:
Папа пришел когда? — Когда вы ушли.

Перед обособленным обстоятельством, наречием, дополнением, вводными словами или словосочетаниями ставится запятая.
Пример:
Не смотря на дождь, мы пошли гулять.