Слово "эндокринная" написано с двумя буквами "н", так как происходит от основы "эндокрин-", которая в свою очередь образована от греческого слова "эндо" (внутри) и "крин-" (видеть, выделять). Таким образом, правильное написание слова "эндокринная" с двумя буквами "н" обусловлено этими этими грамматическими особенностями.