Да, "тонет" и "утонуть" являются одними из коренных слов. Это можно объяснить тем, что оба слова происходят от одного основного корня - "тон-". В данном случае, это корень означает процесс погружения, погружения в воду или другую жидкость. Таким образом, слова "тонет" и "утонуть" оба относятся к этому общему значению и образовались от одного корня.