Світлова та електронна мікроскопія мають свої власні можливості та обмеження, які роблять їх корисними в різних областях науки та дослідження.

Світлова мікроскопія дозволяє спостерігати живі клітини та тканини в нативному стані, а також вимірювати розміри та форму об'єктів. Вона є швидшою та простішою у використанні, ніж електронна мікроскопія, і дозволяє отримувати високу якість зображень без спеціальної підготовки зразка.

Електронна мікроскопія, з іншого боку, надає значно вищу роздільну здатність та здатність до зображення об'єктів у надвисокому збільшенні. Вона також дозволяє досліджувати структурні деталі об'єктів на атомному та молекулярному рівнях, що є неможливим для світлової мікроскопії.

Обидва типи мікроскопії є важливими для наукових досліджень у біології, хімії, фізиці та інших галузях. Вони доповнюють один одного та дозволяють вченим отримувати комплексні та детальні дані про об'єкти, які вони досліджують.