Подземное прорастание семян происходит в почве, где семянка остаётся скрытой от внешней среды. Надземное прорастание, наоборот, происходит на поверхности почвы, где семянка подвержена воздействию света, воды и воздуха. Кроме того, при надземном прорастании семянка образует стебель и листья, тогда как при подземном прорастании она образует корни и только после этого начинает развиваться надземная часть растения.