Гетерозиготность по многим генам в природных популяциях может возникать из-за естественного отбора. Гетерозиготные особи могут иметь преимущества в выживании и размножении по сравнению с гомозиготными особями. Это может быть связано с тем, что гетерозиготные особи имеют более разнообразный генотип, что позволяет им лучше приспосабливаться к изменяющимся условиям окружающей среды.

Также, гетерозиготные особи могут обладать гетерозисом - явлением, при котором потомство гетерозиготных особей имеет улучшенные показатели по сравнению с потомством гомозиготных особей. Это также может способствовать увеличению частоты гетерозиготных особей в популяции.

Таким образом, гетерозитность по многим генам в природных популяциях может быть результатом естественного отбора, способствующего улучшению выживаемости и размножения особей в изменчивой среде.