В основе деления клеток на прокариоты и эукариоты лежит особенность структуры клетки. Прокариоты представляют собой организмы, клетки которых не имеют ядра и других мембранных органелл. У них ДНК представлена в виде одной кольцевой молекулы внутри цитоплазмы. К прокариотам относятся бактерии и археи.

Эукариоты, в свою очередь, имеют ядро, окруженное мембраной, и другие мембранные органеллы, такие как митохондрии, хлоропласты, эндоплазматическая сеть и др. У эукариотов ДНК находится в ядре.

Таким образом, различие между прокариотами и эукариотами заключается в структуре клетки и наличии ядра у эукариотических клеток.