Внутренний слой гидры состоит из клеток, образующих энтодерму, которые отвечают за пищеварение и поглощение пищи, а также за обмен веществ. Кроме того, внутренний слой гидры содержит нервную систему, отвечающую за координацию движений и реакцию на внешние раздражители.