Прокариоты и эукариоты оба могут быть хемоорганотрофами или автотрофами. Хемоорганотрофы получают энергию из органических соединений, таких как глюкоза, путем их окисления. Автотрофы, в свою очередь, могут получать энергию из неорганических источников, таких как свет (фототрофы) или минеральные соединения (хемолитотрофы).

Прокариоты также могут использовать процесс хемосинтеза для получения энергии, осуществляя окисление неорганических соединений для создания химической энергии. Эукариоты, с другой стороны, чаще используют фотосинтез для получения энергии, главным образом зеленые растения и водоросли.

Таким образом, способ питания прокариот и эукариот может значительно различаться в зависимости от их метаболических потребностей и способностей.