У простейших, таких как амёбы и паразитические черви, органы выделения представлены простой системой цитоплазматических мембран и специализированными органеллами. Они выделяют отходы обмена веществ и избавляются от них через цитоплазму или путем осмотического выведения через клеточную мембрану. Некоторые простейшие также способны к обмену газов через всю свою поверхность тела.