Отличие заключается в том, что у амфибий кровеносная система имеет два круга кровообращения – легочный и телесный, тогда как у рептилий – один круг кровообращения. У амфибий также отсутствует артерия, соединяющая правое жаберное и левое телесное кровотоки, которая характерна для рептилий. В кровеносной системе амфибий также отсутствует кишечная артерия, которая является характерной особенностью системы рептилий.