Обмен веществ между ядром и цитоплазмой осуществляется через ядерные поры, которые являются специальными структурами, позволяющими молекулам перемещаться между ядром и цитоплазмой. Большие молекулы, такие как белки, генетическая информация и рибосомы, проходят через ядерные поры в обоих направлениях. Для этого необходимы специфические сигнальные пептиды на молекулах, которые помогают им распознаваться и переноситься через ядерные поры.