С образованием и функционированием плавательного пузыря связано ряд органов и систем организма рыб. В основном, это связано с дыхательной и мочевыделительной системами. Например, в дыхательной системе плавательный пузырь принимает участие в газообмене, позволяя рыбе контролировать свою плавучесть. В мочевыделительной системе он является органом, который помогает регулировать осмотическое равновесие и удалять избыток газа.