Позвоночный столб - рептилии имеют более укрепленный и укороченный позвоночный столб, что позволяет им лучше поддерживать своё тело на суше.

Кожный покров - у рептилий кожный покров более плотный и защищённый, чем у амфибий. У некоторых видов рептилий есть чешуя, которая защищает их от потери влаги и травм.

Дыхательная система - рептилии имеют лёгкие с более разветвлённой структурой, что обеспечивает им более эффективный обмен газами и позволяет дольше задерживать дыхание.

Почки - у рептилий почки более эффективны в удалении продуктов обмена веществ и сохранении воды, что связано с тем, что рептилии живут в основном на суше и могут ограниченно получать воду.

Репродуктивная система - у рептилий развита кладка яиц, а у амфибий встречаются разный способы размножения, включая как кладку яиц, так и развитие лягушек и змей.