Нет, это не рефлекс. При чистке/разрезании лука выделяются комплексы летучих энзимов, в состав которых входит сера. Попадая в глаза, они контактируют со слезной жидкостью. Возникает новая реакция (образуется небольшое количество серной кислоты), сопровождающаяся слезотечением и ощущением жжения на слизистой.