Для исследования последствий мутационной точки в промотере гена, которая приводит к снижению его экспрессии, можно использовать ряд методов, включая:

ПЦР-аналіз (Полимеразная цепная реакция): Можно использовать количественную ПЦР (qPCR) для оценки уровня экспрессии гена с мутацией и без. Это позволит сравнить количество мРНК в клетках с и без мутации.

РТ-ПЦР (Обратная транскрипция ПЦР): Этот метод подходит для определения уровня мРНК. Сравнение уровней мРНК в клетках с мутацией и контрольных клетках поможет оценить уровень экспрессии гена.

Секвенирование ДНК: Для подтверждения наличия мутации в промотере можно использовать секвенирование ДНК.

Люминесцентные репортерные системы: Конструирование репортерных конструкций с мутацией и без. Например, вставка промотера гена в конструкцию с геном флуоресцентного белка и измерение его экспрессии с помощью флуоресцентного микроскопа или флуориметра.

Western blot: Используется для оценки уровня белка, кодируемого исследуемым геном, что позволит проверить, влияет ли пониженная экспрессия мРНК на уровень белка.

ChIP (Иммуноосаждение хроматина): Для изучения связывания транскрипционных факторов с промотером гена и понимания механизма, из-за которого возникает снижение экспрессии.

Клонирование и функциональный анализ: Клонировать мутацию и оценить ее влияние на функцию гена, а также возможные взаимодействия с другими регуляторными элементами.

Флуоресцентная микроскопия: Для визуализации локализации белков и их взаимодействий внутри клетки, что может помочь понять, как мутация влияет на клеточную активность.

Методы редкой нокаута (например, CRISPR/Cas9): Создание клеточных моделей с отключенным или изменённым геном для изучения его функций и взаимодействий.

Конечно, интеграция данных: Сравнение результатов экспрессии с данными транскриптомики и метаболомики для полного понимания влияния мутации.

Эти методы в комплексе помогут тщательно исследовать влияние мутационной точки на экспрессию гена и его функции.