Объясните, как принципы популяционной генетики (эффект основателя, дрейф, миграция, отбор) взаимодействуют при колонизации нового острова и какие прогнозы можно сделать для генетического разнообразия через 100 поколений

18 Ноя в 17:17
6 +1
0
Ответы
1
Коротко о взаимодействии процессов и числовые прогнозы.
1) Что делает каждый процесс (в одну — две формулы/фразы):
- Эффект основателя / бутылочное горлышко: при колонизации исходная частота аллелей выбирается среди небольшого числа особей; теряются редкие аллели, уменьшается богатство аллелей и гетерозиготность. Однопоколенное сокращение до NfN_fNf даёт падение гетерозиготности примерно на множитель (1−12Nf)\bigl(1-\tfrac{1}{2N_f}\bigr)(12Nf 1 ).
- Генетический дрейф: случайные флуктуации частот приводят к дальнейшему уменьшению гетерозиготности по закону
Ht=H0(1−12Ne)t≈H0e−t/(2Ne), H_t = H_0\Bigl(1-\frac{1}{2N_e}\Bigr)^t \approx H_0 e^{-t/(2N_e)},
Ht =H0 (12Ne 1 )tH0 et/(2Ne ),
где NeN_eNe — эффективный размер популяции.
- Миграция (генетический поток): привносит аллели из материка; изменение частоты аллеля на острове за поколение
p′=(1−m)pisland+mpmainland, p'=(1-m)p_{island}+m p_{mainland},
p=(1m)pisland +mpmainland ,
а степень генетического сходства оценивается приближением
FST≈11+4Nem. F_{ST}\approx\frac{1}{1+4N_e m}.
FST 1+4Ne m1 .
- Отбор: поддерживает/сдвигает частоты полезных/вредных аллелей; селекция эффективно действует, когда
Nes≫1, N_e s \gg 1,
Ne s1,
в противном случае дрейф доминирует.
2) Как они взаимодействуют при колонизации:
- Сначала эффект основателя резко снижает богатство аллелей и гетерозиготность; после этого дрейф продолжает терять вариацию, особенно при малых NeN_eNe .
- Миграция противостоит потерям: при достаточном mmm популяция быстро восстанавливает вариацию (малый FSTF_{ST}FST ); при малом mmm остров быстро дифференцируется.
- Отбор может удерживать или фиксировать локально полезные варианты даже при дрейфе, если NesN_e sNe s велик; при малом NeN_eNe и слабом s селекция слабее дрейфа и локальная адаптация затруднена.
3) Прогнозы через 100 поколений — примерные сценарии (берём начальную гетерозиготность H0=0.8H_0=0.8H0 =0.8):
- Сценарий A — малый эффективный размер после основания: Ne=20N_e=20Ne =20, почти отсутствует миграция (m≈0m\approx0m0):
H100=0.8(1−12⋅20)100=0.8⋅0.0795≈0.064. H_{100}=0.8\Bigl(1-\frac{1}{2\cdot 20}\Bigr)^{100}=0.8\cdot 0.0795\approx 0.064.
H100 =0.8(12201 )100=0.80.07950.064.
Ожидается сильная утрата гетерозиготности и большинства редких аллелей; высокая фиксация случайных вариантов.
- Сценарий B — средний Ne=100N_e=100Ne =100, низкая миграция m=0.001m=0.001m=0.001:
H100=0.8(1−12⋅100)100=0.8⋅0.606≈0.485. H_{100}=0.8\Bigl(1-\frac{1}{2\cdot100}\Bigr)^{100}=0.8\cdot 0.606\approx 0.485.
H100 =0.8(121001 )100=0.80.6060.485.
Степень дифференциации от источника по формуле FST≈11+4⋅100⋅0.001=0.714F_{ST}\approx\frac{1}{1+4\cdot100\cdot0.001}=0.714FST 1+41000.0011 =0.714 (сильная дифференциация при очень малом mmm).
- Сценарий C — крупный Ne=500N_e=500Ne =500, умеренная миграция m=0.01m=0.01m=0.01:
H100=0.8(1−12⋅500)100=0.8⋅0.905≈0.724, H_{100}=0.8\Bigl(1-\frac{1}{2\cdot500}\Bigr)^{100}=0.8\cdot 0.905\approx 0.724,
H100 =0.8(125001 )100=0.80.9050.724,
и FST≈11+4⋅500⋅0.01=0.2F_{ST}\approx\frac{1}{1+4\cdot500\cdot0.01}=0.2FST 1+45000.011 =0.2. Вариация близка к исходной, дрейф слабее, миграция поддерживает общую вариативность.
4) Роль селекции в прогнозах:
- Если полезный аллель имеет силу селекции sss и Nes>1N_e s>1Ne s>1, его частота будет определяться отбором, а не дрейфом; вероятность фиксации нового благоприятного мутационного аллеля ~2s2s2s (для диплоидов при малых s).
- При mmm больших, чем порядка sss, миграция может мешать локальной адаптации (приблизительно условие устойчивости локальной адаптации m≲sm\lesssim sms).
Краткие выводы:
- Малые NeN_eNe + низкая миграция → через 100 поколений сильная потеря гетерозиготности и аллельного богатства, высокая дифференциация.
- Средний/большой NeN_eNe и/или значительная миграция → большая часть исходной вариативности сохранится.
- Селекция может сохранить или распространить полезные аллели, но её эффективность определяется величиной NesN_e sNe s.
Если хотите, могу привести таблицу с прогнозами для других комбинаций NeN_eNe , mmm, sss или построить график изменения HtH_tHt .
18 Ноя в 17:23
Не можешь разобраться в этой теме?
Обратись за помощью к экспертам
Гарантированные бесплатные доработки в течение 1 года
Быстрое выполнение от 2 часов
Проверка работы на плагиат
Поможем написать учебную работу
Прямой эфир