Коротко: скорость распространения и закрепления нового мутантного аллеля в большой континентальной популяции определяется главным образом силой и направлением отбора, эффективным размером популяции, поставкой мутаций, структурой популяции и экологическими процессами (миграция, дисперсия, гетерогенность среды), а также генетическими факторами, которые влияют на связность генома (рекомбинация, сцепление, фоновые мутации, эпистаз, доминантность). Основные факторы и их роли (с краткими формулами): Генетические факторы - Селективный коэффициент sss: определяет вероятность и скорость закрепления. Для новой благоприятной мутации в диплоидной популяции при малом sss приближённая вероятность фиксации ≈2s \approx 2s ≈2s. - Начальная частота и источник: для новой однокопийной мутации нейтральная вероятность фиксации =12Ne = \frac{1}{2N_e} =2Ne1. Поставка полезных мутаций за поколение Λ=2Neub \Lambda = 2N_e u_b Λ=2Neub (где ubu_bub — скорость полезных мутаций) определяет, будут ли адаптации из новых мутаций или из standing variation (многоисточечные — «soft sweeps»). - Эффект доминантности hhh: на начальной стадии отбор действует на гетерозиготы с силой hshshs, потому фиксационная вероятность ≈ 2hs2hs2hs при малом sss. - Эффективный размер популяции NeN_eNe: контролирует роль дрейфа; при больших NeN_eNe отбор «работает» эффективнее, среднее время фиксации нейтрального аллеля ∼4Ne \sim 4N_e ∼4Ne поколений. Для полезных аллелей время достижения фиксации порядка ∼ln(2Ne)s \sim \frac{\ln(2N_e)}{s} ∼sln(2Ne) (порядок). - Рекомбинация и сцепление: сильное сцепление уменьшает эффективность отбора из‑за Hill–Robertson interference и фонового отсева; хождение полезного аллеля может замедляться из‑за связанных вредных вариантов. - Эпистаз и плейотропия: изменение эффекта в разных генетических фондах и побочные эффекты на другие признаки могут снижать шансы закрепления. Экологические и пространственные факторы - Миграция/дисперсия (mmm или дисперсионная дисперсия σ2\sigma^2σ2): генетический поток размывает локальную адаптацию; скорость пространственного распространения определяется селекцией и дисперсией. Для континуального распространения волновая скорость Фишера (приближённо) v=2s σ v = 2\sqrt{s}\,\sigma v=2sσ где σ\sigmaσ — среднеквадратичная дистанция расселения за поколение. - Баланс отбор–миграция: ширина градиента (cline) оценивается как w∼σ2s w \sim \sqrt{\frac{\sigma^2}{s}} w∼sσ2 — сильный отбор сужает границы, сильная миграция их размывает. - Пространственная гетерогенность среды: если значение sss меняется в пространстве/времени, аллель может фиксироваться локально, образуя клайны или оставаться полиморфизмом; флуктуации снижает вероятность длительной фиксации. - Плотность и демография: локальные вспышки, узкие места (bottlenecks), неравномерная плотность уменьшают NeN_eNe и усиливают дрейф; при флуктуациях демографии фиксация может происходить быстрее и случайнее. - Биотические взаимодействия и средо‑зависимый отбор: конкуренция, хищничество, патогены могут менять величину sss и её направленность по времени/месту. - Барьеры ландшафта/структура популяции: фрагментация замедляет континентальное распространение, может привести к независимым локальным фиксациям. Дополнительные моменты - Закрепление из стоячей вариации (standing variation) обычно быстрее и вероятнее, чем из единственной новой мутации; часто даёт «soft sweep» (несколько независимых источников). - Интерференция между множественными полезными мутациями (когда Λ \Lambda Λ велико) может замедлять распространение каждой из них. - Временной масштаб: важен переход от поколений к календарному времени через длину поколения ggg. Короткий итог: ключевые параметры — селективный коэффициент sss, эффективный размер популяции NeN_eNe, скорость полезных мутаций ubu_bub (через Λ=2Neub \Lambda = 2N_e u_b Λ=2Neub), дисперсия/миграция σ\sigmaσ или mmm, и уровень рекомбинации rrr. Их сочетание с экологической гетерогенностью и демографией определяет скорость и вероятность закрепления нового аллеля.
Основные факторы и их роли (с краткими формулами):
Генетические факторы
- Селективный коэффициент sss: определяет вероятность и скорость закрепления. Для новой благоприятной мутации в диплоидной популяции при малом sss приближённая вероятность фиксации ≈2s \approx 2s ≈2s.
- Начальная частота и источник: для новой однокопийной мутации нейтральная вероятность фиксации =12Ne = \frac{1}{2N_e} =2Ne 1 . Поставка полезных мутаций за поколение Λ=2Neub \Lambda = 2N_e u_b Λ=2Ne ub (где ubu_bub — скорость полезных мутаций) определяет, будут ли адаптации из новых мутаций или из standing variation (многоисточечные — «soft sweeps»).
- Эффект доминантности hhh: на начальной стадии отбор действует на гетерозиготы с силой hshshs, потому фиксационная вероятность ≈ 2hs2hs2hs при малом sss.
- Эффективный размер популяции NeN_eNe : контролирует роль дрейфа; при больших NeN_eNe отбор «работает» эффективнее, среднее время фиксации нейтрального аллеля ∼4Ne \sim 4N_e ∼4Ne поколений. Для полезных аллелей время достижения фиксации порядка ∼ln(2Ne)s \sim \frac{\ln(2N_e)}{s} ∼sln(2Ne ) (порядок).
- Рекомбинация и сцепление: сильное сцепление уменьшает эффективность отбора из‑за Hill–Robertson interference и фонового отсева; хождение полезного аллеля может замедляться из‑за связанных вредных вариантов.
- Эпистаз и плейотропия: изменение эффекта в разных генетических фондах и побочные эффекты на другие признаки могут снижать шансы закрепления.
Экологические и пространственные факторы
- Миграция/дисперсия (mmm или дисперсионная дисперсия σ2\sigma^2σ2): генетический поток размывает локальную адаптацию; скорость пространственного распространения определяется селекцией и дисперсией. Для континуального распространения волновая скорость Фишера (приближённо)
v=2s σ v = 2\sqrt{s}\,\sigma v=2s σ
где σ\sigmaσ — среднеквадратичная дистанция расселения за поколение.
- Баланс отбор–миграция: ширина градиента (cline) оценивается как w∼σ2s w \sim \sqrt{\frac{\sigma^2}{s}} w∼sσ2 — сильный отбор сужает границы, сильная миграция их размывает.
- Пространственная гетерогенность среды: если значение sss меняется в пространстве/времени, аллель может фиксироваться локально, образуя клайны или оставаться полиморфизмом; флуктуации снижает вероятность длительной фиксации.
- Плотность и демография: локальные вспышки, узкие места (bottlenecks), неравномерная плотность уменьшают NeN_eNe и усиливают дрейф; при флуктуациях демографии фиксация может происходить быстрее и случайнее.
- Биотические взаимодействия и средо‑зависимый отбор: конкуренция, хищничество, патогены могут менять величину sss и её направленность по времени/месту.
- Барьеры ландшафта/структура популяции: фрагментация замедляет континентальное распространение, может привести к независимым локальным фиксациям.
Дополнительные моменты
- Закрепление из стоячей вариации (standing variation) обычно быстрее и вероятнее, чем из единственной новой мутации; часто даёт «soft sweep» (несколько независимых источников).
- Интерференция между множественными полезными мутациями (когда Λ \Lambda Λ велико) может замедлять распространение каждой из них.
- Временной масштаб: важен переход от поколений к календарному времени через длину поколения ggg.
Короткий итог: ключевые параметры — селективный коэффициент sss, эффективный размер популяции NeN_eNe , скорость полезных мутаций ubu_bub (через Λ=2Neub \Lambda = 2N_e u_b Λ=2Ne ub ), дисперсия/миграция σ\sigmaσ или mmm, и уровень рекомбинации rrr. Их сочетание с экологической гетерогенностью и демографией определяет скорость и вероятность закрепления нового аллеля.