Комплексы генов могут влиять на проявление признака у организма, так как они могут взаимодействовать друг с другом или регулировать экспрессию генов, что в свою очередь может повлиять на синтез белков, ответственных за данный признак. Такие взаимодействия и регуляции могут быть как прямыми, так и косвенными, и потому могут оказывать значительное влияние на проявление конкретного признака.