Данные анализа генов и белков современных организмов можно использовать для реконструкции их происхождения, основываясь на следующих методах:

Филогенетический анализ: сравнение генетических последовательностей организмов позволяет построить филогенетическое дерево, которое отражает их эволюционные отношения. Это позволяет определить, какие организмы более близки к друг другу и каков порядок их эволюционного развития.

Сравнительный геномный анализ: сравнение геномов различных организмов позволяет выявить гены, которые у них общие и различные. Это может помочь понять, какие гены оказались унаследованы от общего предка, а какие появились в результате эволюции.

Анализ белков: сравнение структуры и функции белков различных организмов позволяет понять, какие эволюционные изменения привели к разнообразию белков и их функций.

Молекулярно-генетические маркеры: использование определенных участков генома или белков как маркеров позволяет установить эволюционные отношения между организмами и реконструировать их происхождение.

Таким образом, анализ генов и белков современных организмов играет важную роль в понимании их происхождения и эволюции, а также позволяет построить убедительные модели развития живых организмов.