Загрязнение воды. Байкальские нерпы питаются рыбой, которая может быть загрязнена тяжелыми металлами или другими вредными веществами. Это может привести к отравлению и уменьшению численности нерп.

Изменение климата. Изменения температур воды в озере Байкал могут повлиять на размножение и выживаемость нерп. Например, уменьшение ледяного покрова зимой может повлиять на доступность мест для рождения детенышей.

Охота и браконьерство. Незаконная охота на байкальских нерп может привести к сокращению их численности. Также чрезмерная охота может вызвать уменьшение популяции и нарушение экосистемы озера.