Аэробный тип обмена веществ у прокариот возник в условиях наличия кислорода в окружающей среде. Когда уровень кислорода стал достаточно высоким, прокариоты, которые способны использовать кислород для дыхания, могли эффективнее производить энергию, получаемую из пищи. Таким образом, аэробный тип обмена веществ стал выгодным для прокариот, и они начали его использовать в своей жизнедеятельности.