Единство структуры клеток всех живых организмов. Клетки разных организмов имеют сходную структуру и выполнение функций, что свидетельствует о их общем происхождении и эволюции от общего предка.

Гипотеза о митохондриях и хлоропластах как самостоятельных органеллах, которые по происхождению являются эндосимбионтами. То есть эти органеллы были в прошлом независимыми микроорганизмами, которые присоединились к клетке и стали выполнять важные функции внутри нее.

Роль ДНК и РНК в клетке как материала для передачи наследственной информации. Структура и функции генетического материала сильно связаны с эволюцией организмов и приспособленностью их к окружающей среде.

Процессы мутации и естественного отбора, которые формируют генетическое разнообразие и дают возможность организмам приспособиться к изменяющимся условиям среды.

Таким образом, клеточная теория предоставляет много доказательств и подтверждений для теории эволюции, объясняя механизмы ее происхождения и развития.