Клетки хламидомонады и хлореллы имеют строение типичное для зеленых водорослей. Они обладают клеточной стенкой, содержащей хлоропласты и хлорофилл, которые отвечают за процесс фотосинтеза. Клетки хламидомонады обычно имеют форму одноклеточных или простых многоклеточных организмов, а клетки хлореллы могут быть как одноклеточными, так и многоклеточными (например, в виде цепочек клеток).